使用時機
- 治療缺氧
- 殺滅藻類
- 傷口消毒
- 消毒缸體與器材
雖然過氧化氫也可以殺滅魚體表的病原，或是驅趕魚體身上的魚蝨與卵圓鞭毛蟲，但是需要的藥物劑量很高，在台灣的水溫下對魚有強烈的毒性，因此不建議使用。
作用機制
過氧化氫是一種強氧化劑，對有機物與金屬有強烈的氧化性。因此可以破壞病毒、細菌、原蟲、藻類的表面，因此可以用來消毒器械、除藻或殺滅魚體上的病原。
過氧化氫在水中會因為水裡的雜質、光與熱而被轉化成水和氧氣，所以過氧化氫具有增氧的效果。每3ppm的過氧化氫就可以提供1ppm的氧氣。
注意事項
1. 高濃度對人皮膚及黏膜具有腐蝕性
大多數藥局買得到的過氧化氫為濃度3%的雙氧水，這個濃度對皮膚的傷害不大。不過如果購買到30%~50%的過氧化氫，使用時就要特別的小心。因為30~60%的雙氧水可以輕易的灼傷皮膚、刺激眼睛與呼吸道造成化學傷害，所以使用的時候一定要帶手套、護目鏡與口罩。不小心接觸到則要快速以溫水持續沖洗20~30分鐘。
2. 高濃度的過氧化氫使用時須遠離火源
因為過氧化氫會分解成水與氧氣，所以高濃度的過氧化氫周遭會有高濃度的氧氣產生。氧氣為優良的助燃劑，會讓可燃性物質更容易燃燒，最糟的情況下可能會變成爆炸。所以在使用高濃度過氧化氫的時候一定要遠離火源。
3. 須保存在能夠透氣的容器裡，否則容器可能會爆裂
過氧化氫為一種不穩定的物質，他會緩慢的分解成氧氣與水。所以若將其放置在密封度太高的容器中，會造成容器內氣壓太高，導致容器爆裂。因此放置過氧化氫的容器氣密性不可太高。
4. 不可以和其他化學藥品一起使用
過氧化氫為一種強氧化劑，如果和其他化學物品使用，可能會造成化學物質的失效，更糟的是可能產生毒性物質。因此過氧化氫只能單獨使用。
5. 溫度越高毒性越高
過氧化氫氧化其他東西的速度取決於溫度，當溫度太高時，不只是目標的物質會被氧化，連魚或是其他水中生物的身體表面也可能會被無差別攻擊，因此溫度高於20度以上的水族箱不建議在有魚的情況下使用過氧化氫。
6. 有機質多的情況下分解的速度會較快
在有機質多的環境中，過氧化氫就會被有機質中和掉，所以如果要用過氧化氫來消毒缸體或器具，最好先使用清水將大型的有機物沖洗掉後再浸泡，效果會更好。
7. 不同魚的耐受性差異很大
不同魚種對過氧化氫的耐受性差異很大，而目前有實驗數據的魚隻大多是溫帶國家的養殖魚類，對熱帶觀賞魚的研究非常的少。
目前只知道青萬隆可以忍受10ppm以下的過氧或氫浸泡1小時或是3ppm以下的過氧化氫浸泡24小時。
琵琶鼠則只要環境中有5ppm以上的過氧化氫就會死亡。
不過也有一些小型的淡水熱帶性魚類，像是紅旗魚、四間鯽和劍尾魚就可以忍受1小時15ppm以下的過氧化氫浸泡，或是24小時5ppm以下的過氧化氫浸泡。
8. 過氧化氫會傷害硝化細菌
過氧化氫可以殺菌，同樣的也會傷害硝化細菌，只要水中有3ppm以上的過氧化氫，存在超過1個小時以上，硝化細菌就會受到影響。所以在使用過氧化氫的時候，最好把生物濾材移除，避免硝化系統崩解
使用劑量
一般增氧時的劑量為1.5ppm，如果要急救缺氧魚的話則用7.5ppm
除藻的劑量為有水生動物的時候5~20ppm，如果可以將水生動物移除則可以用到25~50ppm
消毒傷口的劑量為1%~1.5%
消毒時的劑量為50~500ppm
過氧化氫的種類
在藥局買得到的雙氧水大多是3%的過氧化氫，不過也是要注意一下標示，因為偶爾會有6%的雙氧水製劑。如果跟化工行購買，則可以買到30%或是50%的雙氧水。
雙氧水的使用方式
增氧:
當魚缸出現氧量下降時，如果魚只是單純呼吸變喘，但其餘都還算是正常時，可以在水中每隔12小時就加入1.5ppm的雙氧水進行增氧。期間不需換水，過濾器也可以照常運作，因為低濃度的雙氧水大概12小時就會完全降解完畢，而且對硝化細菌也不會有傷害。
如果魚隻已經因為出現了昏厥現象，則必須要使用到7.5ppm的雙氧水進行緊急增氧。如果是用3%的雙氧水的話，就是每1公升的水加入0.25cc的雙氧水。這個濃度已經會對硝化細菌與無脊椎動物造成損傷，有一些比較敏感的魚也可能會死亡，因此除非事態緊急，否則盡量不要使用到此濃度。使用的時候必須要讓缸中維持有水流，以分散雙氧水，避免局部的高濃度雙氧水傷害魚隻。
除藻:
由於對水生生物的傷害性較大，所以是除藻時的最後手段，主要用來對抗難以清除的藍綠藻或是綠藻。如果是要清除藍綠藻使用的濃度為5~10ppm，清除綠藻則是用15~20ppm，可以用滴管直接噴在想要去除的藻的身上，然後再開啟造流，讓過氧化氫分散到水缸中的每一個部分，大概15分鐘後就可以換掉一半的水，觀察48小時看除藻是否有效。如果需要的話可以重複操作。不過15~20ppm的過氧化氫對某些魚類來說有毒性，因此可以的話還是建議將水生動物移除後再進行此操作。
有些人會使用25~50ppm的過氧化情進行除藻，如果要用此濃度，務必將所有的魚隻移除，而且添加的時候一定要特別注意藥物的均勻度，因此製造水流與緩慢的添加非常重要，否則可能會導致一些比較敏感的苔癬類水草的死亡。也是處理15分鐘後就可以換掉一半以上的水，降低過氧化氫的濃度。如果可以將水草移出單獨用過氧化氫處理也是一個不錯的方法。
此外這些濃度全部都對硝化細菌有毒，因此造水流的方式最好使用過濾器之外的造浪機或市將過濾器中的生物過濾部分移除後再開啟過濾器，否則會造成硝化系統的崩解。
消毒傷口:
魚的傷口上如果有細菌感染的現象，可以使用1%~1.5%的過氧化氫塗抹傷口後，直接將魚隻放回水中，然而過氧化氫會造成嚴重的疼痛，有時候反而會讓魚壓力過高而更容易死亡。
而如果魚隻太小，不好抹藥，使得過氧化氫的處理範圍過大的話，也很容易造成大範圍的體表受損，導致魚隻死亡。因此只建議用在大魚身上。
消毒器械與缸體:
由於過氧化氫降解後只會產生水與氧氣，相較於其他的消毒劑算是較為乾淨的一種。而且過氧化情只要2~3天就會完全降解，因此也不會有殘留的問題。唯獨過氧化氫會腐蝕金屬，因此不適用於金屬類物品的消毒。
若要用過氧化氫進行器械與缸體的消毒可以使用50~500ppm的劑量浸泡30~60分鐘。如果主要是要殺滅原蟲的話劑量就用在250ppm以上，如果只是要殺滅細菌只要250ppm以下的劑量即可。
由於使用的劑量較高，所以建議使用30%或50%的雙氧水進行配置會較方便操作。
副作用
過氧化氫或多或少都會傷害魚隻的體表與鰓，如果環境太髒有可能會造成細菌的伺機性感染，所以治療後一定要特別注意環境的清潔。另外過氧化氫的處理對於的肝臟也會有所負擔，所以使用過氧化氫處理的魚隻生長的速度會些微的下降。
另外缸體中使用高於3ppm的過氧化氫後，可能會造成硝化系統的崩解，導致水質震盪，因此在使用完過氧化氫後必須要密切的監控水質。
中毒反應
過氧化氫的中毒反應主要來自於鰓與體表的受損，所以一開始魚隻會出現激動跳躍與呼吸困難的現象。等到太嚴重時就會直接漂浮於水面上，反應變弱最後死亡。
