使用時機
治療魚隻的體表細菌感染與錨蟲感染，中和硫化氫的毒。雖然也能夠用於消毒缸體，但是所需要的濃度太高，所以不推薦使用。
作用機制
是一種很強的氧化劑，因此會將細菌的細胞內的蛋白質與脂肪都氧化，導致細菌的生理功能受損，造成細菌的死亡。
也因為其能夠氧化硫化氫，將其變成硫酸根，所以可以用來解硫化氫的毒。
注意事項
1. 比較適合用在軟的淡水
過錳酸鉀在酸性環境中的效果較好，鹼性環境中效果比較差。而含有亞鐵離子的水，像是井水、礦泉水或是海水，在與過錳酸鉀作用的情況下會產生氫氧化鐵膠體，這種膠體會堵住魚鰓，影響魚隻呼吸，所以在有大量亞鐵離子的水中不建議使用過錳酸鉀。
2. 會受有機物影響濃度
過錳酸鉀是一種強氧化劑，所以其他氧化劑所不能氧化的東西，過錳酸鉀全部都可以氧化，因此只要少量的有機物存在水中，就能夠讓過錳酸鉀的功能失效，因此最好可以在裸缸且沒有過濾系統的狀態下使用過錳酸鉀。
3. 對無脊椎動物與植物的毒性高
過錳酸鉀在治療濃度會殺死某些無脊椎動物與水生植物，因此在治療的時候最好將魚單獨撈出處理，或是先把植物與無脊椎動物移開。如果缸中有大量的藻類也不建議使用，因為過錳酸鉀會將藻類殺死，導致細菌滋生溶氧下降。
4. 對硝化系統毒性高
過錳酸鉀能夠殺死硝化細菌，因此在使用過錳酸鉀的時候一定要關閉過濾器或是把生物濾材移除，以防硝化細菌被殺死。
5. 必須要避光
過錳酸鉀照光會被分解，導致藥性下降，因使用過錳酸鉀作為治療藥劑的時候，必須要避光治療。
過錳酸鉀的種類
過錳酸鉀目前沒有專屬於水產的用藥，因此都只能去化工行購買。最好能夠購買試藥級的藥物，因為試藥級藥物的純度會比較高。
使用劑量
治療淡水魚寄生蟲與體表的細菌感染:
用1000ppm浸泡10~40秒，或100ppm浸泡5~10分鐘，5ppm浸泡30~60分鐘，或2ppm持續浸泡。
治療錨蟲:
20~25ppm浸泡0.5~3小時，或是直接用1000ppm的過錳酸鉀塗抹被錨蟲叮咬的地方。
解硫化氫的毒:
2ppm持續浸泡。
過錳酸鉀的使用方式
因為過錳酸鉀很容易被水的性質與水中的有機質影響，所以如果選擇用低濃度過錳酸鉀長期浸泡的話，在使用之前必須要先做一個小小的試驗。先用1000ml的純水將1g的過錳酸鉀泡開。然後取8管100ml的缸中水，分別加入0.1ml,0.2ml,0.3ml,0.4ml,0.6ml,0.8ml,1ml還有1.2ml的過錳酸鉀，他們分別代表了1,2,3,4,6,8,10,12ppm的過錳酸鉀，觀察哪一管過錳酸鉀的顏色可以維持15分鐘仍有淡粉紅色，取仍有顏色但濃度最低的那一管的濃度乘以2.5，就是所需要的過錳酸鉀濃度。
例如: 過了15分鐘後1,2,3ppm的水已經變成無色或褐色，4,6,8,10,12的水都還有明顯的粉紅色或紫色，則需要使用的過錳酸鉀濃度就是4X2.5=10ppm。如此做出來的實驗結果，大致上會是讓有活性的過錳酸鉀濃度維持在2ppm左右。
如果是要高濃度但短時間的浸泡魚隻就不需要那麼麻煩，直接取所需要的藥量，用大量的水將藥劑完全溶解後，再將魚隻放入浸泡即可。
若要用塗抹的方式給藥一定要避開鰓，否則會讓鰓受損，嚴重的話可能造成魚隻死亡
副作用
過錳酸鉀會傷害魚的鰓，可能會造成呼吸急促或是浮頭等呼吸困難的現象。如果只是局部塗抹則不會有明顯的問題。
中毒反應
高濃度的過錳酸鉀具有刺激性與腐蝕性，因此魚隻在重毒時會出現激動與體表和魚鰓受損現象，類似燒傷的現象。發生的時候可以加入大量的雙氧水或是維生素C錠快速的中和過錳酸鉀，直到過錳酸鉀的顏色消失，而若魚隻成功存活下來，則必須要每日大量換水與暫停餵食維持水質的乾淨，避免傷口受到二次性感染。
